八路军发动群众坚壁清野，并发动群众武装自卫，广泛开展游击战，抗击日军“扫荡”。1941年8月中旬至10月中旬，日本华北方面军总司令冈村宁次率大批日伪军对晋察冀边抗日根据地北岳区、平西区进行大规模“扫荡”，采取“铁壁合围”“梳篾清剿”“分区扫荡”。9月1日，晋察冀边区党政领导机关被日军突袭包围，被围困于阜平雷堡地区。2日，军区机关巧妙地跳出包围圈。八路军总部调贺龙师、刘伯承师和吕正操部共20余团兵力配合，从东、西、南3面向进攻晋察冀边区的日军后方进击。9月26日，聂荣臻部攻克阜平城，28日克复陈南庄。据载，至10月16日，晋察冀军民作战800多次，部队伤亡2000余人，歼日伪军5500余人。
1941年5月，日军调集大批兵力围攻冀东根据地，冀东军分区部队在玉田县南部损失很大。至9月中旬，冀东部队大部分越过长城挺进热河省南部，坚持冀热辽边游击战。
1941年初，日军先后对山东各根据地进行“扫荡”，均被根据地军民积极抵抗，予以击退。11月2日，日伪军由蒙阴、费县、临沂、莒县、沂水等据点出动，对鲁中沂蒙山区进行“铁壁合围”大“扫荡”。4日，日军偷袭沂南西部八路军山东军区第115师师部。5日夜，第115师师部穿出日军包围圈。